Основными задачами центра являются:

• Анализ состояния окружающей природной среды на территории Атырауской области.
• Определение основных, направлений деятельности, осуществление функций управления и планирование мероприятий по сохранению биологического и ландшафтного разнообразия, особо охраняемым природным территори­ям, экологическому мониторингу и экологическим информаци­онным системам.
• Участие в мониторинге антропогенных источников загрязнения и биоресурсов.
• Обеспечение населения, органов государственной власти и органов местного самоуправления экологической информацией.
• Организация и координация в сфере экологического просвещения, образования и воспитания всех слоев населения Атырауской области.
• Координация и организация взаимодействия университета с общественными  экологическими  движениями,  международное экологическое сотрудничество.